百香果目前比较常见的病虫害有花叶病毒病、百绢病、根腐病、疫霉病、炭疽病以及线虫病等。下面就详细来说一下这些病虫害的防治方法。
1、花叶病毒病（包括畸形果病）
百香果花叶病毒病发生危害比较严重，情况严重的地块发病率高达60-80%，对百香果的正常生长造成严重影响。对于这类百香果病害发生情况，根据前人经验、农业专家的摸索提出以下的防控技术和措施和建议：
（1）做好传毒媒介—蚜虫的防治工作，减轻病害扩散蔓延；从百香果将要上棚开始就要注意病毒病的防治问题。使用吡虫啉、噻虫嗪、吡蚜酮等加上菊酯类等触杀性药剂进行防治蚜虫。也有人做过试验说吡蚜酮的对于刺吸性口器的蚜虫有口针堵塞效应，但对于防治病毒病的传播效果似乎不是很理想。
（2）对于已经有轻微的发生病毒病的时候采取植物诱抗剂+病毒病钝化剂+叶面营养等方式进行综合防控。
（3）如果有可能为防止发生花叶病等病毒病，忌与瓜类作物间作。另外能远离罗汉果种植区域是最好的。
2、根腐病、疫霉病、炭疽病和白绢病
防治病害的主要措施：
（1）做好排水工作，防止果园积水，尤其是部分水田和低洼地区果园，需防止局部积水导致烂根和诱发病害。
（2）在果实采收完毕后，结合修剪清园，将病枝、病叶、病果清出园外烧掉减少病源。
（3）在发现根部病害（根腐及白绢）后及时用药除病，可选用恶霉灵、百菌清、甲基托布津、枯草芽孢杆菌等进行灌根，连续2-3次。
（4）炭疽病建议使用咪鲜胺配合苯醚甲环唑、戊唑醇、吡唑醚菌酯等一同预防和治疗。
（5）疫霉病使用霜脲锰锌、烯酰吗啉、丁子香芹酚等进行预防和治疗。实际上目前有很多药剂可以使用，包括进口产品也很多。如果我们主要在预防上下功夫，是不需要使用太贵的药剂。
3、根部线虫病
主要表现为烂根、苗子不长、根系肿大等症状。与瓜类、罗汉果感染线虫病症状有些类似。实际上线虫在土中是长期存在的，只是看其是否达到防治的阈值。如果使用不充分腐熟的农家肥，加上沙壤土在加上上茬作物是葫芦科类作物，线虫侵害会更加厉害。
主要防治措施：在3-4月份苗子上棚之前使用阿维菌素B2、或者噻唑膦水乳剂进行灌根处理。然后在8-9月份在进行一次灌根。
4、蓟马
主要表现为以成虫和若虫锉吸植株幼嫩组织(枝梢、叶片、花、果实等)汁液，被害的嫩叶、嫩梢变硬卷曲枯萎，叶面 形成密集小白点或长形条斑，植株生长缓慢，节间缩短；幼嫩果实(如茄子、黄瓜、西瓜等)被害后会硬化，严重时造成落果，严重影响产量和品质。田间可利用蓟马趋蓝色的习性，在田间设置蓝色粘板，诱杀成虫，粘板高度与作物持平。也可使用噻虫嗪、吡虫啉、噻虫胺等进行防治。
5、果实蝇
果实蝇主要危害果实，成虫产卵于果实表皮，使果皮表面隆起，可见有针尖大小的产卵孔存在。卵孵化后幼虫在国内蛀食影响果实外观和商品价值，引起严重减产。果园可以挂黄色粘板或使用糖醋液诱杀成虫；使用灭蝇胺成分的杀虫剂防治，15-20天喷一次。
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